Pakiet: quicktree (2.5-6)

Odnośniki dla quicktree

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego quicktree:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

Neighbor-Joining algorithm for phylogenies

QuickTree is an efficient implementation of the Neighbor-Joining algorithm (PMID: 3447015), capable of reconstructing phylogenies from huge alignments in time less than the age of the universe.

QuickTree accepts both distance matrix and multiple-sequence-aligment inputs. The former should be in PHYLIP format. The latter should be in Stockholm format, which is the native alignment format for the Pfam database. Alignments in various formats can be converted to Stockholm format with the sreformat program, which is part of the HMMer package (hmmer.org).

The tress are written to stdout, in the Newick/New-Hampshire format use by PHYLIP and many other programs

Inne pakiety związane z quicktree

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

sug: hmmer

profile hidden Markov models for protein sequence analysis

lub hmmer2

profile hidden Markov models for protein sequence analysis

Pobieranie quicktree

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
i386	21,8 KiB	60,0 KiB	[lista plików]