Pakiet: r-bioc-genomicalignments (1.42.0-1)

Odnośniki dla r-bioc-genomicalignments

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego r-bioc-genomicalignments:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [bioconductor.org]

Podobne pakiety:

Pakiet eksperymentalny

Ostrzeżenie: Pakiet pochodzi z dystrybucji eksperymentalnej. Oznacza to, że prawdopodobnie jest niestabilny lub zawiera błędy i może spowodować nawet utratę danych. Przed użyciem pakietu proszę koniecznie zapoznać się z dziennikiem zmian i inną dostępną dokumentacją.

BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments

This BioConductor package provides efficient containers for storing and manipulating short genomic alignments (typically obtained by aligning short reads to a reference genome). This includes read counting, computing the coverage, junction detection, and working with the nucleotide content of the alignments.

Inne pakiety związane z r-bioc-genomicalignments

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.4)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: r-api-4.0

Pakiet niedostępny
dep: r-api-bioc-3.20

Pakiet niedostępny
dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.37.0)

generic functions for Bioconductor
dep: r-bioc-biocparallel

BioConductor facilities for parallel evaluation
dep: r-bioc-biostrings (>= 2.55.7)

GNU R string objects representing biological sequences
dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.13.1)

BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.55.3)

BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
dep: r-bioc-iranges (>= 2.23.9)

GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2)

GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import
dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.12)

BioConductor S4 implementation of vectors and lists
dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.9.13)

BioConductor assay container

sug: r-bioc-biocstyle

standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
sug: r-bioc-bsgenome

BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages
sug: r-bioc-deseq2

R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis
sug: r-bioc-edger

Empirical analysis of digital gene expression data in R
sug: r-bioc-genomicfeatures

GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
sug: r-bioc-rtracklayer

GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks
sug: r-bioc-shortread

GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data
sug: r-cran-knitr

GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
sug: r-cran-runit

GNU R package providing unit testing framework

Pobieranie r-bioc-genomicalignments

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
s390x	2 110,6 KiB	3 393,0 KiB	[lista plików]