[ Pakiet źródłowy: bioperl-run ]
Pakiet: bioperl-run (1.7.2-4)
Odnośniki dla bioperl-run
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego bioperl-run:
Opiekunowie:
- Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
- Charles Plessy (Strona QA)
- Andreas Tille (Strona QA)
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [metacpan.org]
Podobne pakiety:
Nakładki na BioPerl: skrypty
Pakiet zawiera skrypty z pakietu BioPerl-Run. Instaluje on również wszystkie nakładkowe aplikacje pakowane w Debianie. Aplikacje, które nie są wolne są "Sugerowane" przez ten pakiet.
Inne pakiety związane z bioperl-run
|
|
|
|
-
- dep: bioperl
- Narzędzia do obliczeniowej biologii molekularnej, oparte na Perlu
-
- dep: libbio-perl-run-perl (= 1.7.2-4)
- BioPerl wrappers: modules
-
- dep: perl
- praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
-
- rec: amap-align
- Wielokrotne wyrównywanie białek poprzez sekwencyjne wyżarzanie
-
- rec: bedtools
- suite of utilities for comparing genomic features
-
- rec: blast2
- transitional dummy package to ncbi-blast+-legacy
-
- rec: bowtie
- Ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- rec: bwa
- Burrows-Wheeler Aligner
-
- rec: clustalw
- global multiple nucleotide or peptide sequence alignment
-
- rec: emboss
- European molecular biology open software suite
-
- rec: exonerate
- generic tool for pairwise sequence comparison
-
- rec: hmmer
- profile hidden Markov models for protein sequence analysis
-
- rec: hyphy-mpi
- Hypothesis testing using Phylogenies (MPI version)
-
- rec: infernal
- Wyrównywanie drugorzędowej struktury RNA
-
- rec: kalign
- Globalne i progresywne dopasowywanie wielu sekwencji
-
- rec: mafft
- Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
-
- rec: maq
- maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences
-
- rec: muscle
- Multiple alignment program of protein sequences
-
- rec: ncoils
- Przewidywanie budowy zwiniętej spirali drugorzędowej struktury
-
- rec: phylip
- package of programs for inferring phylogenies
-
- rec: phyml
- Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood
-
- rec: primer3
- tool to design flanking oligo nucleotides for DNA amplification
-
- rec: probalign
- multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities
-
- rec: probcons
- PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment
-
- rec: raxml
- Randomizowane maksymalne prawdopodobieństwo drzew filogenetycznych
-
- rec: samtools
- Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM
-
- rec: sim4
- tool for aligning cDNA and genomic DNA
-
- rec: t-coffee
- Wielosekwencyjne wyrównanie
-
- rec: tigr-glimmer
- Gene detection in archea and bacteria
-
- rec: wise
- comparison of biopolymers, like DNA and protein sequences
Pobieranie bioperl-run
| Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|
| all | 44,2 KiB | 104,0 KiB | [lista plików] |