Pakiet: libbio-samtools-perl (1.43-2)

Odnośniki dla libbio-samtools-perl

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego libbio-samtools-perl:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [metacpan.org]

Podobne pakiety:

Perl interface to SamTools library for DNA sequencing

Bio::SamTools provides a Perl interface to the libbam library for indexed and unindexed SAM/BAM sequence alignment databases. It provides support for retrieving information on individual alignments, read pairs, and alignment coverage information across large regions. It also provides callback functionality for calling SNPs and performing other base-by-base functions. Most operations are compatible with the BioPerl Bio::SeqFeatureI interface, allowing BAM files to be used as a backend to the GBrowse genome browser application.

Znaczniki: Rozwój oprogramowania: Rozwijanie w języku Perl, Biblioteki, Zaimplementowane w: implemented-in::c, implemented-in::perl, Rola: Biblioteka deweloperska, Biblioteka współdzielona

Inne pakiety związane z libbio-samtools-perl

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libbio-perl-perl

BioPerl core perl modules
dep: libc6 (>= 2.15) [nie arm64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
dep: perl (>= 5.28.1-4)

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
dep: perlapi-5.28.1

pakiet wirtualny udostępniany przez perl-base
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

enh: gbrowse

GMOD Generic Genome Browser
enh: samtools

Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

Pobieranie libbio-samtools-perl

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	193,1 KiB	624,0 KiB	[lista plików]
arm64	183,2 KiB	604,0 KiB	[lista plików]
armhf	176,5 KiB	489,0 KiB	[lista plików]
i386	205,2 KiB	688,0 KiB	[lista plików]