Pakiet: samblaster (0.1.26-1)

Odnośniki dla samblaster

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego samblaster:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

marks duplicates, extracts discordant/split reads

Current "next-generation" sequencing technologies cannot tell what exact sequence they will be reading. They take what is available. And if some sequences are read very often, then this needs some extra biomedical thinking. The genome could for instance be duplicated.

samblaster is a fast and flexible program for marking duplicates in read-id grouped paired-end SAM files. It can also optionally output discordant read pairs and/or split read mappings to separate SAM files, and/or unmapped/clipped reads to a separate FASTQ file. When marking duplicates, samblaster will require approximately 20MB of memory per 1M read pairs.

Inne pakiety związane z samblaster

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.1.3) [i386]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.2) [mips64el, mipsel]

dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, s390x]
dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]
dep: libstdc++6 (>= 5)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie samblaster

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	25,4 KiB	65,0 KiB	[lista plików]
arm64	23,8 KiB	61,0 KiB	[lista plików]
armel	23,8 KiB	61,0 KiB	[lista plików]
armhf	23,7 KiB	53,0 KiB	[lista plików]
i386	26,5 KiB	65,0 KiB	[lista plików]
mips64el	26,5 KiB	73,0 KiB	[lista plików]
mipsel	26,6 KiB	72,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	27,4 KiB	86,0 KiB	[lista plików]
s390x	23,6 KiB	61,0 KiB	[lista plików]