Pakiet: hinge (0.5.0-6 i inne)

Odnośniki dla hinge

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego hinge:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

long read genome assembler based on hinging

HINGE is a genome assembler that seeks to achieve optimal repeat resolution by distinguishing repeats that can be resolved given the data from those that cannot. This is accomplished by adding “hinges” to reads for constructing an overlap graph where only unresolvable repeats are merged. As a result, HINGE combines the error resilience of overlap-based assemblers with repeat-resolution capabilities of de Bruijn graph assemblers.

Inne pakiety związane z hinge

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: daligner

Odkrywanie lokalnego dopasowania między odczytami długich sekwencji nukleotydowych
dep: dascrubber

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads
dep: dazzdb

manage nucleotide sequencing read data
dep: libc6 (>= 2.27)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libfmt7 (>= 7.1.3+ds1)

fast type-safe C++ formatting library -- library
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: python3-colormap

ease manipulation of matplotlib colormaps and color codecs (Python 3)
dep: python3-matplotlib

Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
dep: python3-networkx

tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)
dep: python3-numpy

Fast array facility to the Python 3 language
dep: python3-pbcore

Python 3 library for processing PacBio data files
dep: python3-ujson

ultra fast JSON encoder and decoder for Python 3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie hinge

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	0.5.0-6+b2	431,8 KiB	2 928,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.5.0-6+b2	392,1 KiB	2 764,0 KiB	[lista plików]
armel	0.5.0-6+b2	372,4 KiB	2 659,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.5.0-6+b2	377,8 KiB	2 123,0 KiB	[lista plików]
i386	0.5.0-6+b2	431,7 KiB	3 075,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.5.0-6+b2	378,9 KiB	3 233,0 KiB	[lista plików]
mipsel	0.5.0-6+b2	383,5 KiB	3 119,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.5.0-6+b2	420,3 KiB	3 444,0 KiB	[lista plików]