Pakiet: r-bioc-bitseq (1.34.0+dfsg-1)

Odnośniki dla r-bioc-bitseq

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego r-bioc-bitseq:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [bioconductor.org]

Podobne pakiety:

transcript expression inference and analysis for RNA-seq data

The BitSeq package is targeted for transcript expression analysis and differential expression analysis of RNA-seq data in two stage process. In the first stage it uses Bayesian inference methodology to infer expression of individual transcripts from individual RNA-seq experiments. The second stage of BitSeq embraces the differential expression analysis of transcript expression. Providing expression estimates from replicates of multiple conditions, Log-Normal model of the estimates is used for inferring the condition mean transcript expression and ranking the transcripts based on the likelihood of differential expression.

Inne pakiety związane z r-bioc-bitseq

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libcurl4 (>= 7.18.0)

Łatwa w użyciu biblioteka klienta do transferu adresów URL (wersja OpenSSL)
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, i386, mips64el, mipsel]
dep: libgomp1 (>= 6)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: r-api-4.0

pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core
dep: r-api-bioc-3.12

pakiet wirtualny udostępniany przez r-bioc-biocgenerics
dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)

GNU R core of statistical computation and graphics system
dep: r-bioc-iranges

GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
dep: r-bioc-rhtslib (>= 1.15.5)

HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package
dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.99.3)

GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import
dep: r-bioc-s4vectors

BioConductor S4 implementation of vectors and lists

sug: r-bioc-biocstyle

standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
sug: r-bioc-deseq

GNU R differential gene expression analysis
sug: r-bioc-edger

Empirical analysis of digital gene expression data in R

Pobieranie r-bioc-bitseq

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1 104,1 KiB	5 998,0 KiB	[lista plików]
arm64	1 062,4 KiB	5 890,0 KiB	[lista plików]
armel	1 041,0 KiB	5 838,0 KiB	[lista plików]
armhf	1 047,6 KiB	5 594,0 KiB	[lista plików]
i386	1 135,7 KiB	6 077,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1 066,9 KiB	6 107,0 KiB	[lista plików]
mipsel	1 070,9 KiB	6 055,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1 132,8 KiB	6 254,0 KiB	[lista plików]
s390x	1 065,5 KiB	6 029,0 KiB	[lista plików]