Pakiet: plasmidseeker (1.3+dfsg-1)

Odnośniki dla plasmidseeker

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego plasmidseeker:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

identification of known plasmids from whole-genome sequencing reads

PlasmidSeeker is a k-mer based program for the identification of known plasmids from bacterial whole genome sequencing reads.

PlasmidSeeker that enables the detection of plasmids from bacterial WGS data without read assembly. The PlasmidSeeker algorithm is based on k-mers and uses k-mer abundance to distinguish between plasmid and bacterial sequences. The performance of PlasmidSeeker was tested on a set of simulated and real bacterial WGS samples, resulting in 100% sensitivity and 99.98% specificity.

Inne pakiety związane z plasmidseeker

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: genometester

toolkit for performing set operations on k-mer lists

Pobieranie plasmidseeker

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	26,4 KiB	94,0 KiB	[lista plików]
arm64	26,4 KiB	94,0 KiB	[lista plików]
armel	26,4 KiB	94,0 KiB	[lista plików]
armhf	26,4 KiB	94,0 KiB	[lista plików]
i386	26,4 KiB	94,0 KiB	[lista plików]
mips64el	26,5 KiB	94,0 KiB	[lista plików]
mipsel	26,4 KiB	94,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	26,4 KiB	94,0 KiB	[lista plików]
s390x	26,4 KiB	94,0 KiB	[lista plików]