Pakiet: libjellyfish-2.0-2 (2.3.0-10)

Odnośniki dla libjellyfish-2.0-2

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego jellyfish:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [www.cbcb.umd.edu]

Podobne pakiety:

count k-mers in DNA sequences (dynamic library of jellyfish)

JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism.

JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.

This package contains the dynamic library the main executable of jellyfish is linked to.

Znaczniki: Rola: Biblioteka współdzielona

Inne pakiety związane z libjellyfish-2.0-2

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.7) [nie amd64, arm64, ppc64el]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

dep: libstdc++6 (>= 9) [nie armel, armhf]

Pobieranie libjellyfish-2.0-2

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	63,6 KiB	198,0 KiB	[lista plików]
arm64	59,5 KiB	189,0 KiB	[lista plików]
armel	55,5 KiB	165,0 KiB	[lista plików]
armhf	55,9 KiB	137,0 KiB	[lista plików]
i386	70,1 KiB	197,0 KiB	[lista plików]
mips64el	60,6 KiB	226,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	69,0 KiB	286,0 KiB	[lista plików]