wszystkie opcje
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: quicktree  ]

Pakiet: libquicktree-dev (2.5-5)

Odnośniki dla libquicktree-dev

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego quicktree:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

Neighbor-Joining algorithm for phylogenies (development)

QuickTree is an efficient implementation of the Neighbor-Joining algorithm (PMID: 3447015), capable of reconstructing phylogenies from huge alignments in time less than the age of the universe.

QuickTree accepts both distance matrix and multiple-sequence-aligment inputs. The former should be in PHYLIP format. The latter should be in Stockholm format, which is the native alignment format for the Pfam database. Alignments in various formats can be converted to Stockholm format with the sreformat program, which is part of the HMMer package (hmmer.org).

The tress are written to stdout, in the Newick/New-Hampshire format use by PHYLIP and many other programs

This package contains some header files from quicktree that are used by other packages.

Znaczniki: Rozwój oprogramowania: Biblioteki, Rola: Biblioteka deweloperska

Pobieranie libquicktree-dev

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 24,8 KiB122,0 KiB [lista plików]
arm64 24,1 KiB120,0 KiB [lista plików]
armel 22,7 KiB110,0 KiB [lista plików]
armhf 22,2 KiB100,0 KiB [lista plików]
i386 25,9 KiB117,0 KiB [lista plików]
mips64el 26,5 KiB141,0 KiB [lista plików]
mipsel 26,2 KiB121,0 KiB [lista plików]
ppc64el 27,6 KiB134,0 KiB [lista plików]
s390x 24,2 KiB122,0 KiB [lista plików]