Pakiet: qcat (1.1.0-2)

Odnośniki dla qcat

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego qcat:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

Demultipleksowanie odczytów Oxford Nanopore z plików FASTQ

Qcat to narzędzie wiersza poleceń służące do demultipleksowania odczytów Oxford Nanopore z plików FASTQ. Akceptuje pliki o nazwie bazowej FASTQ i dzieli odczyty na osobne pliki FASTQ na podstawie ich kodu kreskowego. Qcat tworzy algorytmy demultipleksacyjne używane w albacore/guppy i EPI2ME, dostępne do użytku lokalnego z plikami FASTQ. Obecnie Qcat implementuje algorytm EPI2ME.

Inne pakiety związane z qcat

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: python3-biopython

Python3 library for bioinformatics
dep: python3-parasail (>= 1.2-3)

Python3 bindings for the parasail C library
dep: python3-six

Python 2 and 3 compatibility library (Python 3 interface)
dep: python3-yaml

YAML parser and emitter for Python3

sug: qcat-examples

demultiplexing Oxford Nanopore reads from FASTQ files (examples)

Pobieranie qcat

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	30,3 KiB	269,0 KiB	[lista plików]