Pakiet: tvc (5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5)

Odnośniki dla tvc

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego tvc:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [ioncommunity.thermofisher.com]

Podobne pakiety:

genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms

Torrent Variant Caller (TVC) is a genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms, and is specially optimized to exploit the underlying flow signal information in the statistical model to evaluate variants. Torrent Variant Caller is designed to call single-nucleotide polymorphisms (SNPs), multi-nucleotide polymorphisms (MNPs), insertions, deletions, and block substitutions.

Inne pakiety związane z tvc

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libarmadillo11 (>= 1:11.2.3+dfsg)

streamlined C++ linear algebra library
dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

library for entropy measurement of byte streams
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, mipsel, s390x]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]
dep: libjsoncpp25 (>= 1.9.5)

library for reading and writing JSON for C++
dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)
dep: libstdc++6 (>= 11)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie tvc

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1 049,1 KiB	3 361,0 KiB	[lista plików]
arm64	970,3 KiB	3 221,0 KiB	[lista plików]
armel	940,3 KiB	3 089,0 KiB	[lista plików]
armhf	955,9 KiB	2 705,0 KiB	[lista plików]
i386	1 089,4 KiB	3 452,0 KiB	[lista plików]
mips64el	989,1 KiB	3 755,0 KiB	[lista plików]
mipsel	993,0 KiB	3 608,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1 060,5 KiB	3 733,0 KiB	[lista plików]
s390x	977,7 KiB	3 396,0 KiB	[lista plików]