Pakiet: r-bioc-rsamtools (2.14.0-1)

Odnośniki dla r-bioc-rsamtools

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego r-bioc-rsamtools:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [bioconductor.org]

Podobne pakiety:

GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

This package provides an interface to the 'samtools', 'bcftools', and 'tabix' utilities for manipulating SAM (Sequence Alignment / Map), binary variant call (BCF) and compressed indexed tab-delimited (tabix) files.

Inne pakiety związane z r-bioc-rsamtools

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libcurl4 (>= 7.18.0)

Łatwa w użyciu biblioteka klienta do transferu adresów URL (wersja OpenSSL)
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, i386, mipsel]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: libstdc++6 (>= 11)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: r-api-4.0

pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core
dep: r-api-bioc-3.16

pakiet wirtualny udostępniany przez r-bioc-biocgenerics
dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

GNU R core of statistical computation and graphics system
dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.25.1)

generic functions for Bioconductor
dep: r-bioc-biocparallel

BioConductor facilities for parallel evaluation
dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)

GNU R string objects representing biological sequences
dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.1.3)

BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8)

BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.12)

GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
dep: r-bioc-rhtslib (>= 1.99.3)

HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package
dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.25)

BioConductor S4 implementation of vectors and lists
dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7)

BioConductor representation and manpulation of external sequences
dep: r-bioc-zlibbioc

(Virtual) zlibbioc Bioconductor package
dep: r-cran-bitops

GNU R package implementing bitwise operations

sug: r-bioc-biocstyle

standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
sug: r-bioc-genomicalignments

BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments
sug: r-bioc-genomicfeatures

GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
sug: r-bioc-shortread (>= 1.19.10)

GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data
sug: r-cran-runit

GNU R package providing unit testing framework

Pobieranie r-bioc-rsamtools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	3 667,0 KiB	5 744,0 KiB	[lista plików]
arm64	3 623,2 KiB	5 696,0 KiB	[lista plików]
armel	3 594,5 KiB	5 629,0 KiB	[lista plików]
armhf	3 599,6 KiB	5 373,0 KiB	[lista plików]
i386	3 712,8 KiB	5 897,0 KiB	[lista plików]
mips64el	3 623,9 KiB	5 946,0 KiB	[lista plików]
mipsel	3 638,2 KiB	5 876,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	3 711,2 KiB	6 144,0 KiB	[lista plików]
s390x	3 626,6 KiB	5 828,0 KiB	[lista plików]