Pakiet: fastqtl (2.184+v7+dfsg-3)

Odnośniki dla fastqtl

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego fastqtl:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [fastqtl.sourceforge.net]

Podobne pakiety:

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Interfejs użytkownika: interface::commandline, role::program, Przeznaczenie: Analizowanie

Inne pakiety związane z fastqtl

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libblas3

Implementacje Basic Linear Algebra Reference, biblioteka współdzielona

lub libblas.so.3

pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

Biblioteka Boost.Iostreams
dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

program options library for C++
dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libhts3 (>= 1.10)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libstdc++6 (>= 11)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: r-mathlib

GNU R standalone mathematics library

rec: r-cran-argparser

GNU R command-line argument parser
rec: r-cran-qvalue

Pakiet niedostępny
rec: r-cran-tools

Pakiet niedostępny

sug: fastqtl-doc

QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

Pobieranie fastqtl

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
ppc64el	245,2 KiB	916,0 KiB	[lista plików]