[ buster ] [ bullseye ] [ bullseye-backports ] [ bookworm ] [ trixie ] [ sid ]

[ Pakiet źródłowy: ncbi-blast+ ]

Pakiet: ncbi-blast+ (2.12.0+ds-3 i inne)

Odnośniki dla ncbi-blast+

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego ncbi-blast+:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [www.ncbi.nlm.nih.gov]

Podobne pakiety:

next generation suite of BLAST sequence search tools

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is the most widely used sequence similarity tool. There are versions of BLAST that compare protein queries to protein databases, nucleotide queries to nucleotide databases, as well as versions that translate nucleotide queries or databases in all six frames and compare to protein databases or queries. PSI-BLAST produces a position-specific-scoring-matrix (PSSM) starting with a protein query, and then uses that PSSM to perform further searches. It is also possible to compare a protein or nucleotide query to a database of PSSM’s. The NCBI supports a BLAST web page at blast.ncbi.nlm.nih.gov as well as a network service.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Przeznaczenie: use::analysing, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z ncbi-blast+

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libbz2-1.0

Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa
dep: libc6 (>= 2.33)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgomp1 (>= 6)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

Biblioteka współdzielona LMDB (Lightning Memory-Mapped Database)
dep: libmbedcrypto7 (>= 2.28.0)

lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library
dep: libmbedtls14 (>= 2.28.0)

lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library
dep: libpcre3

Stara biblioteka wyrażeń regularnych, kompatybilna z Perl 5 - pliki wykonywalne
dep: libstdc++6 (>= 11)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: ncbi-data

Platform-independent data for the NCBI toolkit
dep: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

enh: t-coffee

Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie ncbi-blast+

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
mipsel	2.12.0+ds-3+b1	8 748,4 KiB	55 228,0 KiB	[lista plików]