Pakiet: mindthegap (2.3.0-2)

Odnośniki dla mindthegap

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego mindthegap:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

performs detection and assembly of DNA insertion variants in NGS read datasets

Designed to call insertions of any size, whether they are novel or duplicated, homozygous or heterozygous in the donor genome. It takes as input a set of reads and a reference genome. It outputs two sets of FASTA sequences: one is the set of breakpoints of detection insertion sites, the other is the set of assembled insertions for each breakpoint. MindTheGap can also be used as a genome assembly finishing tool. It can fill the gaps between a set of input contigs without any a priori on their relative order and orientation. It outputs the results in gfa file.

Inne pakiety związane z mindthegap

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2+dfsg-7)

dynamic library of the Genome Analysis Toolbox
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libhdf5-103-1

HDF5 C runtime files - serial version
dep: libstdc++6 (>= 11)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie mindthegap

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	242,5 KiB	1 037,0 KiB	[lista plików]
arm64	213,9 KiB	985,0 KiB	[lista plików]
mips64el	197,5 KiB	1 171,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	235,1 KiB	1 177,0 KiB	[lista plików]