wszystkie opcje
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: gsort  ]

Pakiet: gsort (0.1.4-3 i inne)

Odnośniki dla gsort

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego gsort:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

sort genomic data

gsort is a tool to sort genomic files according to a genomefile. For example, to sort VCF to have order: X, Y, 2, 1, 3, ... and the header needs to be kept at the top.

As a more likely example, if a file nneds to be sorted to match GATK order (1 ... X, Y, MT) which is not possible with any other sorting tool. With gsort one can simply place MT as the last chrom in the ".genome" file.

It will also be useful for getting files ready for use in bedtools.

Inne pakiety związane z gsort

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie gsort

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Wersja Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 0.1.4-3+b12 1 800,7 KiB5 239,0 KiB [lista plików]
arm64 0.1.4-3+b12 1 546,8 KiB4 947,0 KiB [lista plików]
armel 0.1.4-3+b12 1 536,4 KiB5 028,0 KiB [lista plików]
armhf 0.1.4-3+b12 1 530,6 KiB5 000,0 KiB [lista plików]
i386 0.1.4-3+b12 1 681,4 KiB5 078,0 KiB [lista plików]
mips64el 0.1.4-3+b12 1 398,7 KiB5 670,0 KiB [lista plików]
mipsel 0.1.4-3+b12 1 433,3 KiB5 632,0 KiB [lista plików]
ppc64el 0.1.4-3+b12 1 515,9 KiB5 011,0 KiB [lista plików]
s390x 0.1.4-3+b12 1 640,2 KiB5 372,0 KiB [lista plików]