Pakiet: bedtools (2.30.0+dfsg-3)

Odnośniki dla bedtools

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego bedtools:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Zestaw, Przeznaczenie: use::analysing, use::comparing, Konwersja danych, use::filtering, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z bedtools

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libbz2-1.0

Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa
dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el, mipsel, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

Biblioteka do kompresji w formacie XZ
dep: libstdc++6 (>= 11)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie bedtools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	649,1 KiB	2 045,0 KiB	[lista plików]
arm64	567,0 KiB	1 877,0 KiB	[lista plików]
armel	537,4 KiB	1 748,0 KiB	[lista plików]
armhf	554,1 KiB	1 260,0 KiB	[lista plików]
i386	717,1 KiB	2 292,0 KiB	[lista plików]
mips64el	582,2 KiB	2 601,0 KiB	[lista plików]
mipsel	601,8 KiB	2 488,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	666,0 KiB	2 517,0 KiB	[lista plików]
s390x	567,4 KiB	2 105,0 KiB	[lista plików]