wszystkie opcje
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: exonerate  ]

Pakiet: exonerate (2.4.0-5)

Odnośniki dla exonerate

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego exonerate:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

generic tool for pairwise sequence comparison

Exonerate allows you to align sequences using a many alignment models, using either exhaustive dynamic programming, or a variety of heuristics. Much of the functionality of the Wise dynamic programming suite was reimplemented in C for better efficiency. Exonerate is an intrinsic component of the building of the Ensembl genome databases, providing similarity scores between RNA and DNA sequences and thus determining splice variants and coding sequences in general.

An In-silico PCR Experiment Simulation System (see the ipcress man page) is packaged with exonerate.

This package also comes with a selection of utilities for performing simple manipulations quickly on fasta files beyond 2Gb

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::TODO, use::searching, Obsługa formatu: Wymaga dodatkowego znacznika, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Inne pakiety związane z exonerate

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie exonerate

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
armel 1 283,0 KiB7 795,0 KiB [lista plików]