Pakket: sniffles (1.0.12b+ds-1)

Verwijzigingen voor sniffles

Debian bronnen:

Het bronpakket sniffles downloaden:

Beheerders:

Externe bronnen:

Homepage [fritzsedlazeck.github.io]

Vergelijkbare pakketten:

structural variation caller using third-generation sequencing

Sniffles is a structural variation (SV) caller using third-generation sequencing data such as those from Pacific Biosciences or Oxford Nanopore platforms. It detects all types of SVs using evidence from split-read alignments, high-mismatch regions, and coverage analysis.

Andere aan sniffles gerelateerde pakketten

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C Bibliotheek: Gedeelde bibliotheken
Ook een virtueel pakket geboden door: libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [niet armel, armhf]

GCC support bibliotheek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU Standard C++ Library v3

sug: bwa

Burrows-Wheeler Aligner

sniffles downloaden

Pakket downloaden voor alle beschikbare platforms
Platform	Pakketgrootte	Geïnstalleerde grootte	Bestanden
amd64	703,3 kB	1.100,0 kB	[overzicht]
arm64	681,9 kB	1.040,0 kB	[overzicht]
armel	674,2 kB	1.027,0 kB	[overzicht]
armhf	680,5 kB	899,0 kB	[overzicht]
i386	717,0 kB	1.127,0 kB	[overzicht]
mips64el	680,8 kB	1.166,0 kB	[overzicht]
mipsel	682,9 kB	1.147,0 kB	[overzicht]
ppc64el	707,2 kB	1.196,0 kB	[overzicht]
s390x	679,3 kB	1.100,0 kB	[overzicht]