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[ ソース: ncbi-blast+ ]

パッケージ: ncbi-blast+ (2.16.0+ds-6)

ncbi-blast+ に関するリンク

Debian の資源:

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メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [www.ncbi.nlm.nih.gov]

類似のパッケージ:

next generation suite of BLAST sequence search tools

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is the most widely used sequence similarity tool. There are versions of BLAST that compare protein queries to protein databases, nucleotide queries to nucleotide databases, as well as versions that translate nucleotide queries or databases in all six frames and compare to protein databases or queries. PSI-BLAST produces a position-specific-scoring-matrix (PSSM) starting with a protein query, and then uses that PSSM to perform further searches. It is also possible to compare a protein or nucleotide query to a database of PSSM’s. The NCBI supports a BLAST web page at blast.ncbi.nlm.nih.gov as well as a network service.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c++, interface::commandline, 役割: プログラム, 目的: use::analysing, works-with::biological-sequence

その他の ncbi-blast+ 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libbz2-1.0

高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム
dep: libc6 (>= 2.38)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.5)

GCC 共有ライブラリ
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

Lightning Memory-Mapped Database shared library
dep: libmbedcrypto7t64 (>= 2.28.0)

lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library
dep: libmbedtls14t64 (>= 2.28.0)

lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library
dep: libmbedx509-1t64 (>= 2.28.0)

lightweight crypto and SSL/TLS library - x509 certificate library
dep: libnghttp2-14 (>= 1.28.0)

HTTP/2 プロトコルを実装するライブラリ (共有ライブラリ)
dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

新しい Perl 互換正規表現ライブラリ - 8 ビットランタイムファイル
dep: libsqlite3-0 (>= 3.6.12)

SQLite 3 共有ライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 14)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3
dep: libuv1t64 (>= 1.33.1)

非同期イベント通知ライブラリ - ランタイムライブラリ
dep: ncbi-data

Platform-independent data for the NCBI toolkit
dep: perl

Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

圧縮ライブラリ - ランタイム

enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

ncbi-blast+ のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
riscv64	14,359.3 kB	56,112.0 kB	[ファイル一覧]