パッケージ: clustalw (2.1+lgpl-7)

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メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [www.clustal.org]

類似のパッケージ:

global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

This program performs an alignment of multiple nucleotide or amino acid sequences. It recognizes the format of input sequences and whether the sequences are nucleic acid (DNA/RNA) or amino acid (proteins). The output format may be selected from in various formats for multiple alignments such as Phylip or FASTA. Clustal W is very well accepted.

The output of Clustal W can be edited manually but preferably with an alignment editor like SeaView or within its companion Clustal X. When building a model from your alignment, this can be applied for improved database searches. The Debian package hmmer creates such in form of an HMM.

タグ: 生物学: Clustal/ALN, タンパク質, 分野: field::biology, field::biology:bioinformatics, 実装言語: implemented-in::c++, interface::commandline, ユーザインタフェース: テキストベースの対話, 役割: role::program, scope::utility, 目的: 比較, サポート形式: works-with-format::plaintext, works-with::TODO

その他の clustalw 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC 共有ライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

sug: clustalx

Multiple alignment of nucleic acid and protein sequences (graphical interface)
sug: seaview

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

enh: bioperl-run

パッケージは利用できません
enh: emboss

ヨーロッパ分子生物学オープンソフトウェアスイート
enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

clustalw のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
ppc64el	276.5 kB	918.0 kB	[ファイル一覧]