パッケージ: concavity (0.1+dfsg.1-5 など)

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ホームページ [compbio.cs.princeton.edu]

類似のパッケージ:

predictor of protein ligand binding sites from structure and conservation

ConCavity predicts protein ligand binding sites by combining evolutionary sequence conservation and 3D structure.

ConCavity takes as input a PDB format protein structure and optionally files that characterize the evolutionary sequence conservation of the chains in the structure file.

The following result files are produced by default:

 * Residue ligand binding predictions for each chain (*.scores).
 * Residue ligand binding predictions in a PDB format file (residue
   scores placed in the temp. factor field, *_residue.pdb).
 * Pocket prediction locations in a DX format file (*.dx).
 * PyMOL script to visualize the predictions (*.pml).

その他の concavity 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC 共有ライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 5)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

sug: conservation-code

protein sequence conservation scoring tool
sug: pymol

Molecular Graphics System

concavity のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
riscv64	0.1+dfsg.1-5+b1	242.3 kB	885.0 kB	[ファイル一覧]