パッケージ: python3-vcf (0.6.8+git20170215.476169c-10 など)

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類似のパッケージ:

Variant Call Format (VCF) parser for Python 3

The Variant Call Format (VCF) specifies the format of a text file used in bioinformatics for storing gene sequence variations. The format has been developed with the advent of large-scale genotyping and DNA sequencing projects, such as the 1000 Genomes Project.

The intent of this module is to mimic the ``csv`` module in the Python stdlib, as opposed to more flexible serialization formats like JSON or YAML. ``vcf`` will attempt to parse the content of each record based on the data types specified in the meta-information lines -- specifically the ##INFO and ##FORMAT lines. If these lines are missing or incomplete, it will check against the reserved types mentioned in the spec. Failing that, it will just return strings.

This package provides the Python 3 modules.

その他の python3-vcf 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, sparc64]
dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: python3

対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)

dep: python3 (<< 3.13) [hppa, ppc64, sparc64 以外]

dep: python3 (<< 3.9) [hppa, ppc64, sparc64]

dep: python3 (>= 3.11~) [hppa, ppc64, sparc64 以外]

dep: python3 (>= 3.7~) [hppa, ppc64, sparc64]
dep: python3-pkg-resources

pkg_resources を用いたパッケージ検索およびリソースアクセス
dep: python3-pysam [hppa, ppc64, sparc64 以外]

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

python3-vcf のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	0.6.8+git20170215.476169c-10	53.1 kB	236.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	0.6.8+git20170215.476169c-10	55.1 kB	214.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	0.6.8+git20170215.476169c-10	50.9 kB	234.0 kB	[ファイル一覧]
armel	0.6.8+git20170215.476169c-10	50.3 kB	186.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	0.6.8+git20170215.476169c-10	51.2 kB	166.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	0.6.8+git20170215.476169c-3	56.8 kB	229.0 kB	[ファイル一覧]
i386	0.6.8+git20170215.476169c-10	55.5 kB	210.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	0.6.8+git20170215.476169c-10	59.6 kB	274.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	0.6.8+git20170215.476169c-10	50.4 kB	198.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	0.6.8+git20170215.476169c-10	50.0 kB	238.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	0.6.8+git20170215.476169c-3	57.4 kB	361.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	0.6.8+git20170215.476169c-10	54.2 kB	234.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	0.6.8+git20170215.476169c-10+b1	64.6 kB	217.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	0.6.8+git20170215.476169c-10	57.0 kB	232.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	0.6.8+git20170215.476169c-3	53.4 kB	237.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	0.6.8+git20170215.476169c-10	56.4 kB	202.0 kB	[ファイル一覧]