パッケージ: python3-pyspoa (0.2.1-1 など)

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メンテナ:

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類似のパッケージ:

Python bindings to spoa

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

This package presents Python bindings for the spoa library

その他の python3-pyspoa 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.32) [alpha, ia64, sh4 以外]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.32) [alpha]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, hppa, ia64, m68k 以外]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.8) [ia64]

SIMD partial order alignment library

dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4) [ia64 以外]
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, m68k]

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

dep: libstdc++6 (>= 14) [ia64, m68k 以外]
dep: libunwind8 [ia64]

プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.14) [ia64 以外]

dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

dep: python3 (>= 3.12~) [ia64 以外]

python3-pyspoa のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	0.0.10-1+b3	74.5 kB	413.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	0.2.1-1	78.6 kB	337.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	0.2.1-1	71.0 kB	409.0 kB	[ファイル一覧]
armel	0.2.1-1	72.4 kB	407.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	0.2.1-1	72.4 kB	279.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	0.2.1-1	78.0 kB	347.0 kB	[ファイル一覧]
i386	0.2.1-1	84.5 kB	327.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	0.0.10-1+b1	90.3 kB	498.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	0.2.1-1	75.3 kB	295.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	0.2.1-1	72.2 kB	423.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	0.2.1-1	79.3 kB	409.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	0.2.1-1	79.3 kB	409.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	0.2.1-1	78.8 kB	257.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	0.2.1-1	77.4 kB	337.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	0.2.1-1	94.8 kB	409.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	0.2.1-1	64.2 kB	2,083.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	0.2.1-1	78.4 kB	311.0 kB	[ファイル一覧]