[ ソース: htseq ]
パッケージ: python3-htseq (2.0.5-1 など)
python3-htseq に関するリンク
Debian の資源:
htseq ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [www-huber.embl.de]
類似のパッケージ:
Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities
HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:
* Getting statistical summaries about the base-call quality scores to
study the data quality.
* Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in
a genome browser.
* Reading in annotation data from a GFF file.
* Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and
genes.
This package contains the Python 3 module.
その他の python3-htseq 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el]
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- dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, m68k 以外]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [x32 以外]
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
- dep: libstdc++6 (>= 5) [x32]
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- dep: python3
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
- dep: python3 (<< 3.13) [x32 以外]
- dep: python3 (<< 3.9) [x32]
- dep: python3 (>= 3.11~) [x32 以外]
- dep: python3 (>= 3.8~) [x32]
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- dep: python3-numpy [x32]
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
- dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0) [x32 以外]
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- dep: python3-numpy-abi9 [x32 以外]
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy
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- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
python3-htseq のダウンロード
| アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|---|
| alpha (非公式の移植版) | 2.0.5-1 | 422.9 kB | 2,164.0 kB | [ファイル一覧] |
| amd64 | 2.0.5-1 | 477.5 kB | 1,837.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 2.0.5-1 | 415.0 kB | 1,836.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 2.0.5-1 | 411.3 kB | 1,668.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 2.0.5-1 | 420.4 kB | 1,276.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 2.0.5-1 | 475.3 kB | 1,914.0 kB | [ファイル一覧] |
| m68k (非公式の移植版) | 2.0.5-1 | 401.3 kB | 1,652.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 2.0.5-1 | 378.0 kB | 2,076.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 2.0.5-1 | 453.0 kB | 2,156.0 kB | [ファイル一覧] |
| riscv64 | 2.0.5-1 | 471.9 kB | 1,472.0 kB | [ファイル一覧] |
| sh4 (非公式の移植版) | 2.0.5-1 | 536.4 kB | 1,622.0 kB | [ファイル一覧] |
| x32 (非公式の移植版) | 0.11.3-1 | 268.1 kB | 816.0 kB | [ファイル一覧] |