[ ソース: pbbam ]
パッケージ: pbbamtools (2.4.0+dfsg-1 など)
pbbamtools に関するリンク
Debian の資源:
pbbam ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [pbbam.readthedocs.org]
類似のパッケージ:
processing Pacific Biosciences binary alignment/map files
The BAM format is a binary, compressed, record-oriented container format for raw or aligned sequence reads. The associated SAM format is a text representation of the same data. The specifications for BAM/SAM are maintained by the SAM/BAM Format Specification Working Group.
PacBio-produced BAM files are fully compatible with the BAM specification, but makes use of the extensibility mechanisms of the BAM specification to encode PacBio-specific information.
This package provides command-line utilities for working with PacBio BAM files.
その他の pbbamtools 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, m68k, sh4 以外]
- dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ia64, m68k, sh4 以外]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libhts3 (>= 1.10) [m68k, sh4]
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: libhts3t64 (>= 1.17) [m68k, sh4 以外]
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: libpbbam1.3.0 (= 1.3.0+dfsg-2) [m68k, sh4]
- Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library
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- dep: libpbbam2.4.0 (= 2.4.0+dfsg-1+b3) [m68k, sh4 以外]
- Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library
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- dep: libpbcopper1.3.0 (>= 1.4.0+dfsg) [m68k, sh4]
- data structures, algorithms, and utilities for C++ applications
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- dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0+dfsg) [m68k, sh4 以外]
- data structures, algorithms, and utilities for C++ applications
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k, sh4 以外]
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k, sh4]
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- dep: libunwind8 [ia64]
- プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
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- rec: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
pbbamtools のダウンロード
| アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|---|
| alpha (非公式の移植版) | 2.4.0+dfsg-1+b3 | 120.9 kB | 686.0 kB | [ファイル一覧] |
| amd64 | 2.4.0+dfsg-1+b3 | 129.6 kB | 475.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 2.4.0+dfsg-1+b3 | 115.8 kB | 619.0 kB | [ファイル一覧] |
| ia64 (非公式の移植版) | 2.4.0+dfsg-1+b3 | 145.0 kB | 712.0 kB | [ファイル一覧] |
| m68k (非公式の移植版) | 1.3.0+dfsg-2 | 79.1 kB | 274.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 2.4.0+dfsg-1+b3 | 120.5 kB | 703.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 2.4.0+dfsg-1+b3 | 126.8 kB | 683.0 kB | [ファイル一覧] |
| riscv64 | 2.4.0+dfsg-1+b3 | 122.4 kB | 363.0 kB | [ファイル一覧] |
| sh4 (非公式の移植版) | 1.3.0+dfsg-2 | 88.0 kB | 256.0 kB | [ファイル一覧] |