パッケージ: garli-mpi (2.1-7 など)

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メンテナ:

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類似のパッケージ:

phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (MPI)

GARLI, Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference is a program for inferring phylogenetic trees. Using an approach similar to a classical genetic algorithm, it rapidly searches the space of evolutionary trees and model parameters to find the solution maximizing the likelihood score. It implements nucleotide, amino acid and codon-based models of sequence evolution, and runs on all platforms. The latest version adds support for partitioned models and morphology-like datatypes.

This version of Garli is using MPI.

その他の garli-mpi 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [ia64, sh4 以外]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libncl2 (>= 2.1.18) [amd64]

NEXUS Class Library

dep: libncl2 (>= 2.1.21+git20210811.b1213a7) [amd64 以外]
dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

high performance message passing library -- shared library
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3
dep: libunwind8 [ia64]

プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
dep: openmpi-bin

high performance message passing library -- binaries

garli-mpi のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	2.1-7+b1	619.2 kB	1,685.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.1-7+b1	551.0 kB	1,493.0 kB	[ファイル一覧]
armel	2.1-7+b1	513.8 kB	1,376.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	2.1-7+b1	488.1 kB	952.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	2.1-7+b1	591.1 kB	1,508.0 kB	[ファイル一覧]
i386	2.1-7+b1	547.4 kB	1,580.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	2.1-7+b1	937.5 kB	3,298.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	2.1-7+b1	519.4 kB	1,604.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.1-7+b1	592.0 kB	1,849.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	2.1-7+b1	631.8 kB	1,813.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.1-7+b1	685.6 kB	1,813.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	2.1-7+b2	646.5 kB	1,285.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	2.1-7+b1	499.3 kB	1,589.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	2.1-7+b1	673.2 kB	1,430.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	2.1-7+b1	519.3 kB	2,080.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	2.1-7+b1	621.0 kB	1,644.0 kB	[ファイル一覧]