パッケージ: bali-phy (3.6.1+dfsg-2 など)

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メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [www.bali-phy.org]

類似のパッケージ:

Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny

BAli-Phy estimates multiple sequence alignments and evolutionary trees from unaligned DNA, amino acid, or codon sequences. BAli-Phy uses MCMC to estimate evolutionary trees, positive selection, and branch lengths while averaging over alternative alignments. BAli-Phy can display alignment ambiguity graphically in an alignment uncertainty (AU) plot.

BAli-Phy can also estimate phylogenies from a fixed alignment (like MrBayes and BEAST) using substitution models like GTR+gamma. BAli-Phy automatically estimates relative rates for each gene.

その他の bali-phy 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libboost-chrono1.71.0 [x32]

パッケージは利用できません
dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

時間、時刻、クロックの C++ 表現
dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0) [ia64, x32 以外]

時間、時刻、クロックの C++ 表現
dep: libboost-filesystem1.71.0 [x32]

パッケージは利用できません
dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)
dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0) [ia64, x32 以外]

C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)
dep: libboost-program-options1.71.0 [x32]

パッケージは利用できません
dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

C++ 用プログラムオプションライブラリ
dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [ia64, x32 以外]

C++ 用プログラムオプションライブラリ
dep: libboost-random1.71.0 [x32]

パッケージは利用できません
dep: libboost-random1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

Boost 乱数ライブラリ
dep: libboost-random1.83.0 (>= 1.83.0) [ia64, x32 以外]

Boost 乱数ライブラリ
dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, x32 以外]
dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

Cairo 二次元ベクトルグラフィックライブラリ
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ppc64el, s390x]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, ppc64, sparc64, x32]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [alpha, ia64, x32 以外]

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

dep: libstdc++6 (>= 14-20240221-2.1) [alpha]

dep: libstdc++6 (>= 9) [ia64, x32]
dep: libunwind8 [ia64]

プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
dep: perl

Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語
dep: python3

対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)

rec: gnuplot

Command-line driven interactive plotting program.
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
rec: r-base

GNU R 統計計算・グラフィックスシステム

sug: figtree

グラフィカルな系統樹ビューア
sug: seaview

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

bali-phy のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	3.6.1+dfsg-2+b1	6,091.7 kB	39,083.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	3.6.1+dfsg-2+b1	6,382.7 kB	37,532.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	3.6.1+dfsg-2+b1	5,733.5 kB	35,384.0 kB	[ファイル一覧]
armel	3.6.1+dfsg-2+b1	4,895.0 kB	31,410.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	3.6.1+dfsg-2+b1	4,485.1 kB	23,018.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	3.6.1+dfsg-2	6,090.5 kB	36,336.0 kB	[ファイル一覧]
i386	3.6.1+dfsg-2+b1	6,163.5 kB	36,222.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	3.6.1+dfsg-1	9,006.8 kB	69,870.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	3.6.1+dfsg-2+b1	5,523.4 kB	34,831.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	3.6.1+dfsg-2+b1	5,714.9 kB	43,529.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	3.6.1+dfsg-2+b1	5,936.4 kB	42,892.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	3.6.1+dfsg-2+b1	6,244.1 kB	41,282.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	3.6.1+dfsg-2+b3	6,366.5 kB	30,588.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	3.6.1+dfsg-2+b1	5,010.0 kB	35,052.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	3.6.1+dfsg-2+b1	5,065.6 kB	63,553.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	3.5.0.1+dfsg-1	5,788.7 kB	33,442.0 kB	[ファイル一覧]