[ ソース: r-bioc-variantannotation ]
パッケージ: r-bioc-variantannotation (1.52.0-1)
r-bioc-variantannotation に関するリンク
Debian の資源:
r-bioc-variantannotation ソースパッケージをダウンロード:
- [r-bioc-variantannotation_1.52.0-1.dsc]
- [r-bioc-variantannotation_1.52.0.orig.tar.gz]
- [r-bioc-variantannotation_1.52.0-1.debian.tar.xz]
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [bioconductor.org]
類似のパッケージ:
試験的な (experimental の) パッケージ
警告: このパッケージは experimental ディストリビューションのものです。つまり、おそらく不安定でバグがあり、それどころかデータの損失を起こすかもしれません。使用前には、変更履歴やその他の参照可能なドキュメントを必ず調べてください。
BioConductor annotation of genetic variants
This BioConductor package provides R functions to annotate variants, compute amino acid coding changess and to predict coding outcomes.
その他の r-bioc-variantannotation 関連パッケージ
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- dep: libbz2-1.0
- 高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libcurl4t64 (>= 7.18.0)
- 使いやすいクライアントサイドの URL 転送ライブラリ (OpenSSL フレーバ)
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- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- XZ 形式の圧縮ライブラリ
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- dep: r-api-4.0
- パッケージは利用できません
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- dep: r-api-bioc-3.20
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-bioc-biocgenerics
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- dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.27.9)
- GNU R Annotation Database Interface for BioConductor
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- dep: r-bioc-biobase
- base functions for Bioconductor
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- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.37.0)
- generic functions for Bioconductor
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- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.57.2)
- GNU R string objects representing biological sequences
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- dep: r-bioc-bsgenome (>= 1.47.3)
- BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages
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- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)
- BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
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- dep: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.31.3)
- GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
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- dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.41.5)
- BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
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- dep: r-bioc-iranges (>= 2.23.9)
- GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
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- dep: r-bioc-matrixgenerics
- S4 Generic Summary Statistic Functions that Operate on Matrix-Like Objects
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- dep: r-bioc-rhtslib (>= 2.99.0)
- HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package
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- dep: r-bioc-rsamtools (>= 2.19.1)
- GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import
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- dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.39.7)
- GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks
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- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.12)
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
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- dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.19.5)
- BioConductor assay container
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- dep: r-bioc-xvector (>= 0.29.2)
- BioConductor representation and manpulation of external sequences
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- dep: r-bioc-zlibbioc
- (Virtual) zlibbioc Bioconductor package
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- dep: r-cran-dbi
- GNU R package providing a generic database interface
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
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- sug: r-bioc-annotationhub
- GNU R client to access AnnotationHub resources
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- sug: r-bioc-biocstyle
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
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- sug: r-bioc-snpstats
- BioConductor SnpMatrix and XSnpMatrix classes and methods
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- sug: r-cran-ggplot2
- implementation of the Grammar of Graphics
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- sug: r-cran-httr
- GNU R tools for working with URLs and HTTP
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- sug: r-cran-jsonlite
- Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R
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- sug: r-cran-knitr
- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
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- sug: r-cran-magick
- advanced graphics and image-processing in GNU R
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- sug: r-cran-runit
- GNU R package providing unit testing framework
r-bioc-variantannotation のダウンロード
| アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|
| amd64 | 3,465.7 kB | 6,804.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 3,448.4 kB | 6,820.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 3,438.1 kB | 6,922.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64 (非公式の移植版) | 3,499.1 kB | 7,210.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 3,498.7 kB | 7,076.0 kB | [ファイル一覧] |
| riscv64 | 3,477.0 kB | 6,656.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 3,479.9 kB | 6,904.0 kB | [ファイル一覧] |