パッケージ: libhts3t64 (1.21+ds-0+exp2) [debports]
試験的な (experimental の) パッケージ
警告: このパッケージは experimental ディストリビューションのものです。つまり、おそらく不安定でバグがあり、それどころかデータの損失を起こすかもしれません。使用前には、変更履歴やその他の参照可能なドキュメントを必ず調べてください。
C library for high-throughput sequencing data formats
HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.
HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension ‘csi’ (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.
その他の libhts3t64 関連パッケージ
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- dep: libbz2-1.0
- 高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.18.0)
- 使いやすいクライアントサイドの URL 転送ライブラリ (GnuTLS フレーバ)
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- dep: libdeflate0 (>= 1.0)
- fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression
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- dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)
- Custom compression for CRAM and others
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- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- XZ 形式の圧縮ライブラリ
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- dep: libssl3t64 (>= 3.0.0)
- Secure Sockets Layer ツールキット - 共有ライブラリ
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム