パッケージ: cd-hit (4.6.8-2)

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類似のパッケージ:

suite of programs designed to quickly group sequences

cd-hit contains a number of programs designed to quickly group sequences. cd-hit groups proteins into clusters that meet a user-defined similarity threshold. cd-hit-est is similar to cd-hit, but designed to group nucleotide sequences (without introns). cd-hit-est-2d is similar to cd-hit-2d but designed to compare two nucleotide datasets. A number of other related programs are also in this package. Please see the cd-hit user manual, also part of this package, for further information.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c++, implemented-in::perl, ユーザインタフェース: コマンドライン, 役割: role::program, use::comparing, 取り扱い対象: 生物学的配列

その他の cd-hit 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.7)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.5)

GCC 共有ライブラリ
dep: libgomp1 (>= 4.9)

GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3
dep: perl

Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語

cd-hit のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
armhf	484.1 kB	1,083.0 kB	[ファイル一覧]