すべてのオプション
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ ソース: trf  ]

パッケージ: trf (4.09.1-4)

trf に関するリンク

Screenshot

Debian の資源:

trf ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

類似のパッケージ:

locate and display tandem repeats in DNA sequences

A tandem repeat in DNA is two or more adjacent, approximate copies of a pattern of nucleotides. Tandem Repeats Finder is a program to locate and display tandem repeats in DNA sequences. In order to use the program, the user submits a sequence in FASTA format. There is no need to specify the pattern, the size of the pattern or any other parameter. The output consists of two files: a repeat table file and an alignment file. The repeat table, viewable in a web browser, contains information about each repeat, including its location, size, number of copies and nucleotide content. Clicking on the location indices for one of the table entries opens a second browser page that shows an alignment of the copies against a consensus pattern. The program is very fast, analyzing sequences on the order of .5Mb in just a few seconds. Submitted sequences may be of arbitrary length. Repeats with pattern size in the range from 1 to 2000 bases are detected.

その他の trf 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • enhances

trf のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 56.4 kB167.0 kB [ファイル一覧]
arm64 52.2 kB155.0 kB [ファイル一覧]
armel 54.7 kB162.0 kB [ファイル一覧]
armhf 52.8 kB142.0 kB [ファイル一覧]
i386 55.8 kB174.0 kB [ファイル一覧]
mips64el 55.1 kB175.0 kB [ファイル一覧]
mipsel 54.6 kB170.0 kB [ファイル一覧]
ppc64el 57.6 kB183.0 kB [ファイル一覧]
s390x 54.0 kB163.0 kB [ファイル一覧]