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パッケージ: spoa (4.0.7+ds-1 など)

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類似のパッケージ:

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

その他の spoa 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • enhances

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アーキテクチャ バージョン パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 4.0.7+ds-1+b1 37.1 kB79.0 kB [ファイル一覧]
arm64 4.0.7+ds-1+b1 35.9 kB75.0 kB [ファイル一覧]
armel 4.0.7+ds-1+b1 34.9 kB74.0 kB [ファイル一覧]
armhf 4.0.7+ds-1+b1 34.4 kB62.0 kB [ファイル一覧]
i386 4.0.7+ds-1+b1 37.8 kB78.0 kB [ファイル一覧]
mips64el 4.0.7+ds-1+b1 36.7 kB85.0 kB [ファイル一覧]
mipsel 4.0.7+ds-1+b1 36.3 kB80.0 kB [ファイル一覧]
ppc64el 4.0.7+ds-1+b1 38.0 kB99.0 kB [ファイル一覧]
s390x 4.0.7+ds-1+b1 36.0 kB79.0 kB [ファイル一覧]