パッケージ: theseus (3.3.0-9)

theseus に関するリンク

Debian の資源:

theseus ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [www.theseus3d.org]

類似のパッケージ:

superimpose macromolecules using maximum likelihood

Theseus is a program that simultaneously superimposes multiple macromolecular structures. Theseus finds the optimal solution to the superposition problem using the method of maximum likelihood. By down-weighting variable regions of the superposition and by correcting for correlations among atoms, the ML superposition method produces very accurate structural alignments.

When macromolecules with different residue sequences are superimposed, other programs and algorithms discard residues that are aligned with gaps. Theseus, however, uses a novel superimposition algorithm that includes all of the data.

タグ: 生物学: タンパク質, 分野: 生物学, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, 実装言語: C, ユーザインタフェース: interface::commandline, role::program, 目的: 解析, use::comparing, works-with-format::plaintext

その他の theseus 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: clustalo

General-purpose multiple sequence alignment program for proteins
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libgsl25 (>= 2.6)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: muscle

タンパク質配列のマルチプルアライメントプログラム

sug: clustalw

global multiple nucleotide or peptide sequence alignment
sug: dialign

Segment-based multiple sequence alignment
sug: kalign

グローバルおよびプログレッシブ多重配列アライメント
sug: mafft

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
sug: probcons

確率的で整合性に基づく多重配列アライメント
sug: t-coffee

Multiple Sequence Alignment
sug: theseus-examples

superimpose macromolecules using maximum likelihood (examples)

theseus のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	375.4 kB	975.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	343.0 kB	811.0 kB	[ファイル一覧]
armel	283.3 kB	821.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	265.9 kB	566.0 kB	[ファイル一覧]
i386	283.1 kB	821.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	324.3 kB	834.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	337.4 kB	871.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	405.6 kB	1,003.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	284.3 kB	827.0 kB	[ファイル一覧]