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パッケージ: tantan (23-1)

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low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c++, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: scope::utility, works-with::biological-sequence

その他の tantan 関連パッケージ

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アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 37.9 kB106.0 kB [ファイル一覧]
arm64 34.8 kB94.0 kB [ファイル一覧]
armel 34.0 kB93.0 kB [ファイル一覧]
armhf 32.8 kB73.0 kB [ファイル一覧]
i386 39.7 kB105.0 kB [ファイル一覧]
mips64el 40.2 kB123.0 kB [ファイル一覧]
mipsel 40.4 kB117.0 kB [ファイル一覧]
ppc64el 39.8 kB146.0 kB [ファイル一覧]
s390x 35.8 kB106.0 kB [ファイル一覧]