[ ソース: samblaster ]
パッケージ: samblaster (0.1.26-1)
samblaster に関するリンク
Debian の資源:
samblaster ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
marks duplicates, extracts discordant/split reads
Current "next-generation" sequencing technologies cannot tell what exact sequence they will be reading. They take what is available. And if some sequences are read very often, then this needs some extra biomedical thinking. The genome could for instance be duplicated.
samblaster is a fast and flexible program for marking duplicates in read-id grouped paired-end SAM files. It can also optionally output discordant read pairs and/or split read mappings to separate SAM files, and/or unmapped/clipped reads to a separate FASTQ file. When marking duplicates, samblaster will require approximately 20MB of memory per 1M read pairs.
その他の samblaster 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.1.3) [i386]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.2) [mips64el, mipsel]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, s390x]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]
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- dep: libstdc++6 (>= 5)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
samblaster のダウンロード
| アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|
| amd64 | 25.4 kB | 65.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 23.8 kB | 61.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 23.8 kB | 61.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 23.7 kB | 53.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 26.5 kB | 65.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 26.5 kB | 73.0 kB | [ファイル一覧] |
| mipsel | 26.6 kB | 72.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 27.4 kB | 86.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 23.6 kB | 61.0 kB | [ファイル一覧] |