[ ソース: gmap ]
パッケージ: gmap (2021-02-22+ds-1)
gmap に関するリンク
Debian の資源:
gmap ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
- Debian Med Packaging Team (QA ページ, メールアーカイブ)
- Shaun Jackman (QA ページ)
- Andreas Tille (QA ページ)
- Alexandre Mestiashvili (QA ページ)
- Nilesh Patra (QA ページ)
外部の資源:
- ホームページ [research-pub.gene.com]
類似のパッケージ:
spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads
This package contains the programs GMAP and GSNAP as well as utilities to manage genome databases in GMAP/GSNAP format. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) is a tool for aligning EST, mRNA and cDNA sequences. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) is a tool for aligning single-end and paired-end transcriptome reads. Both tools can use a database of
* known splice sites and identify novel splice sites. * known single-nucleotide polymorphisms (SNPs).GSNAP can align bisulfite-treated DNA.
その他の gmap 関連パッケージ
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- dep: libbz2-1.0
- 高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: perl
- Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
gmap のダウンロード
| アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|
| amd64 | 11,332.0 kB | 86,543.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 6,976.6 kB | 57,915.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 5,605.3 kB | 43,621.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 5,756.4 kB | 41,853.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 5,907.0 kB | 43,773.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 5,324.5 kB | 54,666.0 kB | [ファイル一覧] |
| mipsel | 5,291.6 kB | 45,235.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 7,219.0 kB | 60,727.0 kB | [ファイル一覧] |