パッケージ: fastqtl (2.184+dfsg-7 など)

fastqtl に関するリンク

Debian の資源:

fastqtl ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [fastqtl.sourceforge.net]

類似のパッケージ:

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, ユーザインタフェース: interface::commandline, role::program, 目的: 解析

その他の fastqtl 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libblas3

基本線形代数のリファレンス実装 - 共有ライブラリ

または libblas.so.3

以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

Boost.Iostreams ライブラリ
dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

C++ 用プログラムオプションライブラリ
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgsl25 (>= 2.6)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libhts3 (>= 1.10)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libstdc++6 (>= 5.2) [mipsel 以外]

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

dep: libstdc++6 (>= 9) [mipsel]
dep: r-mathlib

GNU R - スタンドアローンな数学ライブラリ

sug: fastqtl-doc

QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

fastqtl のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	2.184+dfsg-7+b4	195.7 kB	669.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.184+dfsg-7+b4	172.3 kB	617.0 kB	[ファイル一覧]
armel	2.184+dfsg-7+b4	161.1 kB	576.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	2.184+dfsg-7+b4	164.0 kB	436.0 kB	[ファイル一覧]
i386	2.184+dfsg-7+b4	200.3 kB	676.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.184+dfsg-7+b4	169.6 kB	752.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	2.184+dfsg-7+b4	171.3 kB	731.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.184+dfsg-7+b4	197.6 kB	761.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	2.184+dfsg-7+b4	166.8 kB	657.0 kB	[ファイル一覧]