[ ソース: bio-eagle ]
パッケージ: bio-eagle (2.4.1-3 など)
bio-eagle に関するリンク
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メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [data.broadinstitute.org]
類似のパッケージ:
Haplotype phasing within a genotyped cohort or using a phased reference panel
Eagle estimates haplotype phase either within a genotyped cohort or using a phased reference panel. The basic idea of the Eagle1 algorithm is to harness identity-by-descent among distant relatives—which is pervasive at very large sample sizes but rare among smaller numbers of samples—to rapidly call phase using a fast scoring approach. In contrast, the Eagle2 algorithm analyzes a full probabilistic model similar to the diploid Li-Stephens model used by previous HMM-based methods.
Please note: The executable was renamed to bio-eagle because of a name clash. Please read more about this in /usr/share/doc/bio-eagle/README.Debian.
その他の bio-eagle 関連パッケージ
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- dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)
- Boost.Iostreams ライブラリ
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- dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)
- C++ 用プログラムオプションライブラリ
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: libopenblas0
- Optimized BLAS (linear algebra) library (meta)
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- rec: med-config (>= 2.1)
- Debian Med general config package
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- sug: bio-eagle-examples
- Examples for bio-eagle