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パッケージ: python3-edlib (1.2.6-1)

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類似のパッケージ:

library for sequence alignment using edit distance (Python3 module)

A lightweight and super fast C/C++ library for sequence alignment using edit distance.

Calculating edit distance of two strings is as simple as:

 edlibAlign("hello", 5, "world!", 6,
            edlibDefaultAlignConfig()).editDistance;
Features

 * Calculates edit distance (Levehnstein distance).
 * It can find optimal alignment path (instructions how to transform
   first sequence into the second sequence).
 * It can find just the start and/or end locations of alignment path -
   can be useful when speed is more important than having exact
   alignment path.
 * Supports multiple alignment methods: global(NW), prefix(SHW) and
   infix(HW), each of them useful for different scenarios.
 * You can extend character equality definition, enabling you to e.g.
   have wildcard characters, to have case insensitive alignment or to
   work with degenerate nucleotides.
 * It can easily handle small or very large sequences, even when finding
   alignment path, while consuming very little memory.
 * Super fast thanks to Myers's bit-vector algorithm.

This package contains the Python3 module.

その他の python3-edlib 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • enhances

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アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 57.3 kB168.0 kB [ファイル一覧]
arm64 51.9 kB164.0 kB [ファイル一覧]
armel 49.5 kB147.0 kB [ファイル一覧]
armhf 50.8 kB115.0 kB [ファイル一覧]
i386 59.5 kB175.0 kB [ファイル一覧]
mips64el 52.5 kB181.0 kB [ファイル一覧]
mipsel 53.3 kB171.0 kB [ファイル一覧]
ppc64el 61.3 kB228.0 kB [ファイル一覧]
s390x 52.0 kB176.0 kB [ファイル一覧]