パッケージ: plink1.9 (1.90~b6.21-201019-1)
plink1.9 に関するリンク
Debian の資源:
plink1.9 ソースパッケージをダウンロード:
- [plink1.9_1.90~b6.21-201019-1.dsc]
- [plink1.9_1.90~b6.21-201019.orig.tar.xz]
- [plink1.9_1.90~b6.21-201019-1.debian.tar.xz]
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [www.cog-genomics.org]
類似のパッケージ:
whole-genome association analysis toolset
plink expects as input the data from SNP (single nucleotide polymorphism) chips of many individuals and their phenotypical description of a disease. It finds associations of single or pairs of DNA variations with a phenotype and can retrieve SNP annotation from an online source.
SNPs can evaluated individually or as pairs for their association with the disease phenotypes. The joint investigation of copy number variations is supported. A variety of statistical tests have been implemented.
plink1.9 is a comprehensive update of plink with new algorithms and new methods, faster and less memory consumer than the first plink.
Please note: The executable was renamed to plink1.9 because of a name clash. Please read more about this in /usr/share/doc/plink1.9/README.Debian.
その他の plink1.9 関連パッケージ
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- dep: libblas3
- 基本線形代数のリファレンス実装 - 共有ライブラリ
- または libblas.so.3
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
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- dep: liblapack3
- 線形代数ルーチンライブラリ 3 - 共有ライブラリ版
- または liblapack.so.3
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libstdc++6 (>= 5)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム