パッケージ: nanolyse (1.2.0-1)

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類似のパッケージ:

remove lambda phage reads from a fastq file

NanoLyse is a tool for rapid removal of contaminant DNA, using the Minimap2 aligner through the mappy Python binding. A typical application would be the removal of the lambda phage control DNA fragment supplied by ONT, for which the reference sequence is included in the package. However, this approach may lead to unwanted loss of reads from regions highly homologous to the lambda phage genome.

その他の nanolyse 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: python3

対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
dep: python3-biopython

Python3 library for bioinformatics
dep: python3-mappy

Python3 interface minimap2

nanolyse のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	24.5 kB	66.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	24.5 kB	66.0 kB	[ファイル一覧]
armel	24.5 kB	66.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	24.5 kB	66.0 kB	[ファイル一覧]
i386	24.5 kB	66.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	24.5 kB	66.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	24.5 kB	66.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	24.5 kB	66.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	24.5 kB	66.0 kB	[ファイル一覧]