パッケージ: mhap (2.1.3+dfsg-3)

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メンテナ:

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ホームページ [mhap.readthedocs.org]

類似のパッケージ:

locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps

The MinHash Alignment Process (MHAP--pronounced MAP) is a reference implementation of a probabilistic sequence overlapping algorithm. Designed to efficiently detect all overlaps between noisy long-read sequence data. It efficiently estimates Jaccard similarity by compressing sequences to their representative fingerprints composed on min-mers (minimum k-mer).

その他の mhap 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: default-jre-headless

標準的な Java または Java 互換のランタイム (ヘッドレス)
dep: jaligner

Smith-Waterman algorithm with Gotoh's improvement
dep: jarwrapper

Run executable Java .jar files
dep: libcommons-compress-java

Java API for working with compression and archive formats
dep: libfastutil-java

Java API providing type-specific maps, sets, lists and queues
dep: libguava-java (>= 19)

Java 用 Google コモンライブラリスイート
dep: libssw-java

Java bindings for libssw

mhap のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
all	156.5 kB	192.0 kB	[ファイル一覧]