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postprocessing and classification of LTR retrotransposons

LTRsift is a graphical desktop tool for semi-automatic postprocessing of de novo predicted LTR retrotransposon annotations, such as the ones generated by LTRharvest and LTRdigest. Its user-friendly interface displays LTR retrotransposon candidates, their putative families and their internal structure in a hierarchical fashion, allowing the user to "sift" through the sometimes large results of de novo prediction software. It also offers customizable filtering and classification functionality.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, ユーザインタフェース: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, 対象範囲: ユーティリティ, インタフェースツールキット: GTK, 目的: use::analysing, use::browsing, 比較, データの編成, use::viewing, x11::application

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