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パッケージ: libgkarrays1 (2.1.0+dfsg-4)

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library to query large collection of NGS sequences

Gk-arrays are provided as a simple-to-use C++ library dedicated to queries on large collection of sequences as produced by high-throughput sequencers (e.g. HiSeq 2000 from Illumina, 454 from Roche).

Gk-arrays index k-mers of reads and allows one to answer different queries on that read collection (e.g. how many reads share this k-mer? where does this k-mer occur in the read collection?).

Gk-arrays consist of a space-efficient alternative to hash tables while being similar in terms of query times.

その他の libgkarrays1 関連パッケージ

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i386 61.9 kB178.0 kB [ファイル一覧]
mips64el 55.0 kB180.0 kB [ファイル一覧]
mipsel 60.8 kB177.0 kB [ファイル一覧]
ppc64el 58.1 kB243.0 kB [ファイル一覧]
s390x 51.9 kB166.0 kB [ファイル一覧]