[ ソース: htslib ]
パッケージ: libhts3 (1.16+ds-3)
libhts3 に関するリンク
Debian の資源:
htslib ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
- Debian Med Packaging Team (QA ページ, メールアーカイブ)
- Charles Plessy (QA ページ)
- Andreas Tille (QA ページ)
- Michael R. Crusoe (QA ページ)
- Steffen Moeller (QA ページ)
- Étienne Mollier (QA ページ)
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
C library for high-throughput sequencing data formats
HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.
HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension ‘csi’ (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.
その他の libhts3 関連パッケージ
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- dep: libbz2-1.0
- 高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)
- 使いやすいクライアントサイドの URL 転送ライブラリ (GnuTLS フレーバ)
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- dep: libdeflate0 (>= 1.0)
- fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression
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- dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)
- Custom compression for CRAM and others
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- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- XZ 形式の圧縮ライブラリ
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- dep: libssl3 (>= 3.0.0)
- Secure Sockets Layer ツールキット - 共有ライブラリ
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム