パッケージ: kalign (1:3.3.5-1)

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類似のパッケージ:

グローバルおよびプログレッシブ多重配列アライメント

Kalign は、生物学的配列の多重アライメント実行用コマンドラインツールです。アライメントの正確さと速度の両方を改善するため、Muth-Manber の文字列照合アルゴリズムを使用します。グローバルかつプログレッシブなアライメント手法を利用しており、その上で、配列間距離の計算への近似文字列照合アルゴリズムの使用と、ローカルのマッチを別のグローバルアライメントに組み込むことにより、機能がさらに強化されています。

タグ: 生物学: Clustal/ALN, タンパク質, 分野: field::biology, field::biology:bioinformatics, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: use::comparing, works-with-format::plaintext, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

その他の kalign 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libgomp1 (>= 4.9)

GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ

enh: bioperl-run

BioPerl wrappers: scripts
enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

kalign のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
armel	78.9 kB	303.0 kB	[ファイル一覧]