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Package: clonalorigin (1.0-3)

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inferenza di ricombinazione omologa in batteri usando sequenze di genomi interi

I batteri, diversamente da noi, si possono riprodurre da soli. Hanno però meccanismi che trasferiscono il DNA tra organismi, un processo più formalmente noto come ricombinazione. I meccanismi con i quali la ricombinazione ha luogo sono stati studiati ampiamente in laboratorio, ma molto rimane da essere compreso a riguardo come, quando e dove la ricombinazione ha luogo all'interno di popolazioni naturali di batteri e come li aiuta ad adattarsi a nuovi ambienti. ClonalOrigin esegue un'analisi comparativa delle sequenze di un campione di genomi di batteri al fine di ricostruire gli eventi di ricombinazione che hanno avuto luogo nella loro ascendenza.

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