Paquet : travis (220729-1 et autres)

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Paquets similaires :

analyse et visualisation de trajectoires

TRAVIS (Trajectory Analyzer and Visualizer) est un outil libre pour analyser et visualiser les trajectoires de toutes sortes de simulations de dynamique moléculaire ou de Monte-Carlo. Le but de TRAVIS est de collecter autant d’analyses que possible en un seul programme, créant ainsi un outil puissant et en rendant inutile l’utilisation de beaucoup de programmes différents pour l’évaluation de simulations. Cela doit grandement rationaliser et simplifier le déroulement des opérations dans l’analyse des trajectoires. Les fonctions d’analyse suivantes sont disponibles :

Fonctions statiques (indépendantes du temps) :

 – fonctions de distribution radiale, angulaire, de dièdres ou combinée ;
 – distribution de distances d'un point à un plan ou d'un point à une ligne ;
 – distribution de projections planes ;
 – profil de densité de plan fixe ;
 – fonctions de distribution de densités, spatiale ou de dipôles.

Fonctions dynamiques (dépendantes du temps) :

 – fonction de distribution de vitesses ;
 – coefficients de déplacement ou de diffusion quadratique moyen ;
 – fonctions d'auto-corrélation de vitesse ;
 – dynamiques de réorientation de vecteur ;
 – fonction de corrélation de Van Hove ;
 – fonctions d'agrégation (DACF, DLDF, DDisp).

Fonctions spectroscopiques :

 – calcul de spectre de puissance ;
 – calcul de spectre IR ;
 – calcul de spectre Raman.

TRAVIS peut lire les fichiers de trajectoire au format XYZ, PDB, LAMMPS ou DLPOLY.

Autres paquets associés à travis

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, s390x]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el, riscv64]
dep: libstdc++6 (>= 11) [non riscv64]

bibliothèque standard C++ de GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

sug: cp2k

Paquet indisponible
sug: gnuplot

programme de tracé interactif en ligne de commande
un paquet virtuel est également fourni par gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
sug: grace

outil de tracé graphique en XY
sug: graphviz

ensemble complet d'outils pour tracer des graphes
sug: pymol

système de graphismes moléculaires

Télécharger travis

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	220729-1	1 637,5 ko	4 686,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	220729-1	1 373,9 ko	4 270,0 ko	[liste des fichiers]
armel	220729-1	1 489,3 ko	4 781,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	220729-1	1 434,2 ko	3 373,0 ko	[liste des fichiers]
i386	220729-1	1 670,8 ko	5 085,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	220729-1	1 411,2 ko	5 514,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	220729-1	1 560,9 ko	5 294,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	220729-1+b1	1 587,5 ko	3 859,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	220729-1	1 414,8 ko	4 638,0 ko	[liste des fichiers]